Fundación
El 25 de junio de 1783, por encargo del virrey del Río de la Plata Juan José de Vértiz y Salcedo, Tomás de Rocamora fundó la Villa de Nuestra Señora de la Inmaculada Concepción del Uruguay, levantando el primer cabildo al norte de la población existente, en lo que actualmente es el centro administrativo y comercial de la ciudad. Existen discusiones acerca del nombre completo de la ciudad, ya que algunas versiones afirman que se limita simplemente a Concepción del Uruguay.
Epicentro de la escena provincial
En 1810, enterados del movimiento que se había suscitado en Buenos Aires, la ciudad fue de las primeras en adherirse a la causa de la Revolución de Mayo.
El 28 de marzo de 1814 se produjo el Combate de Arroyo de la China, cuando una escuadra realista al mando de Jacinto de Romarate derrotó a una fuerza comandada por el capitán Tomás Nother.
En 1814 el Director Supremo Gervasio Antonio Posadas, haciendo uso de las facultades extraordinarias que le confiriera la Asamblea General Constituyente, declaró a Concepción del Uruguay capital de la Provincia de Entre Ríos al momento de la creación de ésta. El 29 de junio de 1815 el general José Gervasio Artigas convocó el primer congreso independentista, que fue celebrado en la ciudad con el nombre de Congreso de Oriente. El mismo tuvo como propósito la declaración de la independencia de las provincias que constituían la Liga Federal y la adopción de la bandera creada por Belgrano con el añadido de la divisa punzó -franja diagonal de color rojo simbolizando el federalismo.
También se resolvió no concurrir al Congreso de Tucumán que se celebraría al año siguiente como señal de protesta hacia el Directorio (unitario) por fomentar la Invasión Luso-Brasileña a la Banda Oriental y por agresiones a diputados federales.
El 19 de mayo de 1818 la villa fue tomada por sorpresa y saqueada por fuerzas portuguesas, hecho conocido como la Sorpresa del Arroyo de la China.
El 1 de febrero de 1820 el general Francisco Ramírez, aliado con el gobernador santafesino Estanislao López, comandó el ejército federal que venció a José Rondeau en la Batalla de Cepeda, firmando poco después el Tratado del Pilar. Posteriormente, Ramírez se distanció de López y el 29 de septiembre del mismo año, proclamó la República de Entre Ríos, la cual incluía además a las actuales provincias de Corrientes y Misiones (en parte), siendo la capital Concepción del Uruguay. Sin embargo la vida de dicha república sería efímera, puesto que se disolvería poco después de la muerte de Ramírez ocurrida el 10 de julio de 1821.
En 1826 el general Justo José de Urquiza, en su función de diputado, promovió la ley que otorgó a Concepción del Uruguay el rango de ciudad.
En 1843, tropas de la Provincia de Corrientes lideradas por el general Joaquín Madariaga desembarcarían con el propósito frustrado de tomar la ciudad.
En 1848 Urquiza, ya como gobernador de Entre Ríos, creó en la ciudad el Colegio del Uruguay, primero en el país de carácter laico.
En 1851 se produjo, a los pies de la pirámide central de la Plaza General Francisco Ramírez, el Pronunciamiento de Urquiza contra Juan Manuel de Rosas, acto que derivaría en la Batalla de Caseros, el 3 de febrero de 1852, en la que Urquiza resultó vencedor y se abrió el camino para la sanción de la Constitución Nacional al siguiente año.
La Convención Provincial reunida en la ciudad en 1860 para sancionar la Constitución Provincial la declararía nuevamente capital provincial, función que tendría hasta el año del centenario, 1883, cuando la capital fue definitivamente trasladada a la ciudad de Paraná.
El 1 de enero de 1873 se creó formalmente el municipio. También el mismo año, durante el auge del Normalismo, Domingo Faustino Sarmiento creó en la ciudad la segunda Escuela Normal del país, luego de la de Paraná y primera de mujeres.
Finales del siglo XIX y comienzos del siglo XX
El 30 de junio de 1887 se habilitó la conexión ferroviaria a través de la línea que luego se integraría en el Ferrocarril General Urquiza con las ciudades de Paraná, Nogoyá y Rosario del Tala. También ese año se reformó el puerto, que alcanzaría en 1910 su mejor época a partir de ser su aduana una de las más importantes del país.
Desarrollo industrial
A lo largo del siglo XX, la ciudad continuó ostentando importancia a nivel cultural y económico, sumándose a los procesos de industrialización que se suceden en el país y estableciéndose allí importantes industrias. En 1994 se celebró en el Palacio San José la jura de la Reforma Constitucional.
Lista de intendentes
Antonio López Piñón (primer intendente por acta del 2 de enero de 1873).
Julio V. Díaz (1874).
José R. Navarro (1874).
Juan L. Caminos (1875).
Domingo Vico (1876).
Mariano Jaime (1876).
Juan Bautista Rey (1877).
Francisco Ratto (1878).
Martín Ruíz Moreno (1878).
Jacobo Gibert (1879).
Pedro Melitón González (1881).
Francisco Ferreyra (1882).
Olegario Mabragaña (1883).
Pedro Melitón González (1885).
Esteban del Castillo (1887).
José Scelzi (1887).
Darío del Castillo (1889).
Benito Pérez (1889).
Rafael M. Paradelo (1890).
Miguel F. Britos (1890).
Agustín Carosini (1893).
Pedro E. Busquet (1893).
Benito Benestead (1894).
Ricardo López Jordán (1896).
Wenceslao S. Gadea (1899).
Porfirio L. Tenreyro (1902).
Juan Leo (1903).
Darío del Castillo (1904).
Vicente M. Corvalán (1906).
Juan B. Martínez (1910).
Juan M. Chiloteguy (1912).
Benito Yáñez (1912).
Miguel Solanas (1912).
Vicente M. Corvalán (1914).
Juan Piñón (1915).
C. González (1920).
Demetrio Etchezarraga (1925).
Olegario Mabragaña (1926).
Antonio E. Bacciadone (1927).
Ernesto T. Marcó (1929).
Juan M. Bruzera (1930).
Albano L. Giménez (1932).
Dr. Justo German Ravenna (1935).
Estos son algunos barrios de Concepción del Uruguay:
2 de abril
12 de octubre
20 de junio
30 de octubre
Bajada Grande
Cantera 25
Centro
El Mirador
Gral. Mosconi
Internacional
Laura Vicuña
Libertad
La Concepción
La Higuera
La Liga
La Quilmes
La Rural
La Tablada
La Unión
Las Quintas
Las Moras
Los Olivos
Los Tanques
Malvinas
Mataderos
Maria Auxiliadora
Obregon
Planta Emisora
Puerto Viejo
Quinta La Paz
Reynaldo Bonnet
Rocamora
San Felipe
San Isidro
San Martin
San Roque
San Vicente
Santa Rita
Santa Teresita
Santa Teresita Norte
Sarmiento
Turf
Villa Industrial
Villa Itape
Villa Las Lomas Sur
Villa Las Lomas Norte
Villa Sol
Zapata